C'est peut-être un problème d'alimentation du ventilo, dont les bornes sont connectées quelque part sur ta carte graphique. Ou le ventilo lui-même. J'ai eu un problème similaire récemment avec une GF 8800GT. La température de ma carte montait à 80°C au repos sous Windows et à 100°C sous Crysis.
Au début le ventilo se déclenchait, mais uniquement à partir de 90°C. Au bout d'un moment, il ne se déclenchait plus. J'ai donc remplacé l'ensemble ventilo + radiateur d'origine par un ventirad Zalman VF900Cu pour une vingtaine d'euros. Le ventilateur du Zalman était cette fois connecté directement sur la prise SYS_FAN de ma carte mère (prise 3 broches). Un potentiomètre était intercalé entre les deux, permettant le réglage de la vitesse du ventilo. Et depuis, la température ne dépasse pas les 40°C au repos et 60°C en charge sous Crysis (réglages à fond).
Après, si tu souhaites prendre un ventirad Zalman (ou même d'une autre marque), renseigne-toi impérativement sur la compatibilité avec ta carte graphique, car l'emplacement des vis de fixation du ventirad peut varier d'une carte à l'autre. Pour les ventirads Zalman, tu trouveras les infos nécessaires sur leur site web. Sur chaque fiche de ventirad sont listées les cartes graphiques compatibles. Par exemple, tu vois ici que mon VF900Cu est compatible avec ta 9400GT :
http://www.zalman.com/ENG/product/Product_Read.asp?idx=144
Vérifie également l'espace disponible dans ta tour. En l'occurrence, mon Zalman cache un de mes ports PCI et le rend inutilisable.
Du reste, il est vrai que changer de carte graphique serait peut-être plus intéressant pour toi. Je trouve régulièrement des HD4850 ou GF8800GT dans les 30-40€ d'occasion sur le net. J'ai aussi acheté une 9500GT pour 15€ récemment, hors frais de port. Reste à voir ton budget, si tu es pressé de changer de carte, et si ton alimentation de PC sera suffisante pour la nouvelle carte.
@doublefoutre : si ta prise SYS_FAN est déjà occupée, tu peux aussi acheter un adaptateur pour la dédoubler, comme celui-ci :
http://www.ldlc.com/fiche/PB00088725.html
Tu peux aussi acheter un adaptateur vers une prise Molex 4 pins :
http://www.ldlc.com/fiche/PB00000238.html